「インデックス・テンプレート」と「テンプレート・モジュール」

サイドバーにある最近のコメントやカテゴリリストなどをモジュール化使用としているのですが…。
ヘッダー及びフッターは「テンプレート・モジュール」を使用する事で難なくモジュール化できたのですが、例えばカテゴリリストなどを「インデックス・テンプレート」で”.php”を用いてモジュール化しようとすると、解説サイトの通りにやっても全く上手くいかず。
ほとんどコピペのはずなのに…何がいけないの？(T^T)